如果申请人只是在台湾转机不入境，并且确认航空公司有转机柜台，不用入境check in 的，可以不需要办理入台证，直接在转机柜台办理转机即可。
另外，请申请人注意：如果是搭乘大陆直飞台湾的航班，无论是何种目的只要是从大陆直飞台湾的，是一定要办妥大通证（大陆居民往来台湾通行证）和有效签注的。否则中国边检不会放行（出境时中国边检只看大通证及有效签注就放行，不看是否有入台证）。
如果申请人没有办理大通证，那就只能再在香港转机了，如：原本上海-台湾-第三国的航线，就需要上海-香港-台湾-第三国这样走才可以。这样的话，就不需要办理大通证。
